2013 年4月11日至13日，国家认监委和农业部聘请4位专家组成评审组，对农业部渔业环境及水产品质检中心（舟山）进行实验室资质认定、农产品质量安全检测机构考核和机构审查认可的现场复查评审，以及食品检验机构资质认定首次评审。
评审组对中心的机构与人员、质量体系、仪器设备、检测工作、记录与报告、设施与环境等六方面进行了仔细的评审。评审组认真听取了中心主任徐汉祥研究员所作的“三年工作总结和质量体系建设情况”，现场察看了中心的实验室等相关工作场所和环境条件，调阅了中心机构设置、人员任命文件，审查了主要仪器设备、承检产品（参数）标准、人员技术档案等资料；审阅了中心质量体系文件、检验报告等相关资料，考查了中心的质量保证体系；召开了全体人员参加的关于计量认证、法律法规、质量管理和专业知识的座谈会；对11名工作人员进行质量技术监督法律法规和质检机构管理知识等相关内容的闭卷考试；对2名授权签字人进行了考核；并从申请承检的项目中，安排了鱿鱼丝等19种产品51个参数进行现场考核，考核结果全部合格。
通过三天的评审，评审组一致认为农业部渔业环境及水产品质检中心（舟山）具备对申请承检的渔业环境、初级水产品、水产加工品、饲料及参数等4大类104个产品、157个参数（共261个项目）进行检测的能力，同意通过现场评审。
现场评审期间，浙江海洋学院吴常文校长和丁国芳处长、农业部科技发展中心崔野韩处长、农业部渔业局郭云峰调研员和中国水产科学研究院马兵副主任先后光临指导并作了重要讲话。
